CEDO Intercultural ha estado trabajando en el Golfo de California y el Desierto de Sonora desde 1979. Durante sus primeros 7 años, CEDO operó bajo los auspicios de la Desert Development Foundation (DDF), una organización de investigación sin fines de lucro asociada con la Universidad de Arizona. Desde entonces, CEDO ha operado desde el Edificio Agustín Cortés y todo el Campus de CEDO en Las Conchas, Puerto Peñasco, Sonora.